Die S9 hat den gemeinsamen Linienweg mit der S8 von Hanau bis nach Mainz-Bischofsheim und dann wieder ab Wiesbaden-Ost bis Wiesbaden-Hauptbahnhof. Es werden 25 Bahnhöfe/Haltepunkte bedient, davon sind 16 behindertengerecht und eine eingeschränkt behindertengerecht ausgebaut. Mit der S8 besteht tagsüber ein 15-Minuten-Takt. Einige Fahrten beginnen/enden in Offenbach-Ost, Frankfurt-Hauptbahnhof und Frankfurt-Flughafen Regionalbahnhof. Hier ist auch der ET 420 auf Fahrt.